Caractérisation génétique animal et identification des régions associées aux phénotypes.
Des informations générales:
Le niveau |
Doctorat |
Titre |
Caractérisation génétique animal et identification des régions associées aux phénotypes. |
SPECIALITE |
Génétique appliquée |
Page de garde:
Sommaire:
Introduction
Introduction
II
III
Dérive génétique
Migration
Sélection
Chapitre I: Revue Bibliographique
1 Notion.
1.1 Facteurs influençant la dynamique de la diversité
Mutation
1.2 Ressources génétiques animales
1.3 Notion d’espèce, population et de race.
1.4 Classification des populations animales domestiques.
Les animaux d’élevages
2.1 L’élevage dans le monde.
Élevage nomade
2.1.2 Système agro-pastoral
Système de transhumance
2.2 L’élevage en Afrique
2.3 L’élevage en Algérie
Les maladies chez les animaux d’élevages
3.1 Les maladies infectieuse et contagieuse.
3.1.1 Les brucelloses
3.1.2 La rage
3.1.3 Les salmonelloses
3.1.4 Les teignes
3.1.5 La tuberculose
3.1.6 La fièvre aphteuse.
3.1.7 La paratuberculose (maladie de johne).
3.1.8 Les helminthoses gastro-intestinales
3.1.9 Les nématodes.
3.1.10 Les cestodes.
3.1.11 La distomatose
3.1.12 La trypanosomose.
3.1.13 La coccidiose des camélidés.
3.1.14 La toxoplasmose
3.1.15 La gale des camélidés
3.1.16 Les infestations par les tiques.
3.1.17 Les myiases.
3.1.18 Les mycoses
3.1.19 Les affections respiratoires et Pasteurella
3.1.20 Les affections à bactéries pyogenes.
Les maladies à Prion chez l’homme et les animaux d’élevage.
Chez l’homme.
Chez les ovins et caprins
Chez les bovins.
Chez les cervidés.
3.2.5 Chez les camélidés
Méthodes de caractérisation des animaux d’élevage
4.1 Méthode morpho biométrique.
4.2 Méthode immunogénétique ou biochimique.
4.3 Méthodes moléculaires
Les allozymes.
Marqueurs de l’ADN mitochondrial
Marqueurs RFLP.
Marqueurs EST
Marqueurs STS.
Marqueurs RAPD
Marqueurs AFLP.
4.3.8 Marqueurs microsatellites
Marqueurs SNP.
4.3.10 Séquençage du génome entier (Whol genome sequencing).
Programmes de conservation des ressources génétiques animales
6 L’apport de la biotechnologie à l’analyse génétique
6.1 Polymorphismes simples des nucléotides (SNP)
6.2 Définition de l’équilibre Hardy-Weinberg (HW) Chapitre II: Partie Experimentale
Matériels et méthodes
1.1 Données morphometrique et phénotypiques.
Mesures morpho métriques (caractérisation phénotypique) 1.1.1.1 L’analyse en composantes principales (ACP) 1.1.1.2 La Classification Ascendante Hiérarchique (CAH).
1.1.1.3 L’analyse des correspondances multiples (ACM). 1.2 Analyse du gène PRNP
Prélèvement sanguin
1.2.2 Extraction de l’ADN
Protocole d’analyse de sequences
1.2.3.1 Préparation de la réaction de PCR
1.2.3.2 Vérification de l’amplification et la détection de la concentration de l’amplicon.64
1.2.3.3 Préparation des réactions de séquençage.
1.2.3.4 Purification des séquences
1.2.3.5 Passage au séquenceur automatique.
Outils bio-informatiques
Résultats et Discussion
2 Résultats et discussion
2.1 Etude morphometrique et phénotypiques de populations de dromadaires.
2.1.2 Classification Ascendante Hiérarchique
2.1.1 Analyse en composante principal
2.2.3 Analyse des Correspondances Multiples
2.2 Etude moléculaire de populations de dromadaires
Conclusion
Conclusion
Référence Bibliographique
Référence Bibliographique
Introduction
II
III
Dérive génétique
Migration
Sélection
Chapitre I: Revue Bibliographique
1 Notion.
1.1 Facteurs influençant la dynamique de la diversité
Mutation
1.2 Ressources génétiques animales
1.3 Notion d’espèce, population et de race.
1.4 Classification des populations animales domestiques.
Les animaux d’élevages
2.1 L’élevage dans le monde.
Élevage nomade
2.1.2 Système agro-pastoral
Système de transhumance
2.2 L’élevage en Afrique
2.3 L’élevage en Algérie
Les maladies chez les animaux d’élevages
3.1 Les maladies infectieuse et contagieuse.
3.1.1 Les brucelloses
3.1.2 La rage
3.1.3 Les salmonelloses
3.1.4 Les teignes
3.1.5 La tuberculose
3.1.6 La fièvre aphteuse.
3.1.7 La paratuberculose (maladie de johne).
3.1.8 Les helminthoses gastro-intestinales
3.1.9 Les nématodes.
3.1.10 Les cestodes.
3.1.11 La distomatose
3.1.12 La trypanosomose.
3.1.13 La coccidiose des camélidés.
3.1.14 La toxoplasmose
3.1.15 La gale des camélidés
3.1.16 Les infestations par les tiques.
3.1.17 Les myiases.
3.1.18 Les mycoses
3.1.19 Les affections respiratoires et Pasteurella
3.1.20 Les affections à bactéries pyogenes.
Les maladies à Prion chez l’homme et les animaux d’élevage.
Chez l’homme.
Chez les ovins et caprins
Chez les bovins.
Chez les cervidés.
3.2.5 Chez les camélidés
Méthodes de caractérisation des animaux d’élevage
4.1 Méthode morpho biométrique.
4.2 Méthode immunogénétique ou biochimique.
4.3 Méthodes moléculaires
Les allozymes.
Marqueurs de l’ADN mitochondrial
Marqueurs RFLP.
Marqueurs EST
Marqueurs STS.
Marqueurs RAPD
Marqueurs AFLP.
4.3.8 Marqueurs microsatellites
Marqueurs SNP.
4.3.10 Séquençage du génome entier (Whol genome sequencing).
Programmes de conservation des ressources génétiques animales
6 L’apport de la biotechnologie à l’analyse génétique
6.1 Polymorphismes simples des nucléotides (SNP)
6.2 Définition de l’équilibre Hardy-Weinberg (HW) Chapitre II: Partie Experimentale
Matériels et méthodes
1.1 Données morphometrique et phénotypiques.
Mesures morpho métriques (caractérisation phénotypique) 1.1.1.1 L’analyse en composantes principales (ACP) 1.1.1.2 La Classification Ascendante Hiérarchique (CAH).
1.1.1.3 L’analyse des correspondances multiples (ACM). 1.2 Analyse du gène PRNP
Prélèvement sanguin
1.2.2 Extraction de l’ADN
Protocole d’analyse de sequences
1.2.3.1 Préparation de la réaction de PCR
1.2.3.2 Vérification de l’amplification et la détection de la concentration de l’amplicon.64
1.2.3.3 Préparation des réactions de séquençage.
1.2.3.4 Purification des séquences
1.2.3.5 Passage au séquenceur automatique.
Outils bio-informatiques
Résultats et Discussion
2 Résultats et discussion
2.1 Etude morphometrique et phénotypiques de populations de dromadaires.
2.1.2 Classification Ascendante Hiérarchique
2.1.1 Analyse en composante principal
2.2.3 Analyse des Correspondances Multiples
2.2 Etude moléculaire de populations de dromadaires
Conclusion
Conclusion
Référence Bibliographique
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