Etude in silico de Foeniculum vulgare comme phytothérapie contre la maladie d’Alzheimer
Des informations générales:
Le niveau |
Master |
Titre |
Etude in silico de Foeniculum vulgare comme phytothérapie contre la maladie d’Alzheimer |
SPECIALITE |
Chimie des Produits Naturels (CPN) |
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Sommaire:
Introduction
Chapitre I: La maladie d’Alzheimer.
1. Définitions
1) Démence
2) Maladie d’Alzheimer
2. Historique
3. Dix signes caractéristiques de la maladie d’Alzheimer
4. Différentes formes de la maladie d’Alzheimer
1. Forme sporadique
2. Forme familiale
5. Facteurs pouvant influencer la maladie
A. Facteurs de risque
· L’âge et le sexe
• Facteurs de risque vasculaire
· Facteurs génétiques
• Facteurs environnementaux
B. Facteurs protecteurs
• Vie sociale
• Alimentation
• Activité physique
6. Lésions de la maladie d’Alzheimer
a. Dépôts extracellulaires du peptide B-amyloïde
Voie non-amyloïdogénique
Voie amyloïdogénique
b. Plaques amyloïdes
C. Dégénérescences neurofibrillaires
7. B-sécrétase
Inhibition de BACE1
8. y-sécrétase
9. Traitements
10. Conclusion
Chapitre II: Présentation de la plante Foeniculum vulgare
1. Historique
2. Description botanique
3. Généralités
4. Noms vernaculaires
5. Habitat et répartition géographique
6. Usages
7. Activité antioxydante et antimicrobienne de Foeniculum vulgare
8. Composition chimique du Foeniculum vulgare
9. Conclusion
Chapitre III: Matériel et méthodes.
1. Introduction
2. Matériels
2.1 Microordinateur
2.2 a. Banques de données
2.3 a. Logiciels utilisés
Généralités sur les enzymes
Acides aminés
b. Sécrétases
2.4 Présentation du matériel
3. Méthodologie de travail
3.1 Introduction
3.2 Méthodes de la modélisation moléculaire
Mécanique moléculaire (MM)
Dynamique moléculaire (DM)
Docking moléculaire
3.3 Protocole de travail
Chapitre IV: Résultats et discussion.
1. Préparation de la protéine (l’enzyme)
2. Préparation des ligands
3. Structures chimiques des ligands
4. Etude in silico de l’inhibition de la ẞ-sécrétase
4.1 Docking moléculaire
a. Comparaison entre les complexes formés (4GID-ligands)
b. Interaction Enzyme-Ligand
4.2 Propriétés de Druglikeness
4.3 Tests ADME/T
4.4 Prédiction PASS et prédiction du site de métabolisme P450
4.5 Prédiction de cible
4.6 Modélisation pharmacophore
→ Docking moléculaire des médicaments
❖ Propriétés de de Druglikeness des médicaments
❖ Test ADME/t des médicaments
Conclusion
Références Bibliographiques
Chapitre I: La maladie d’Alzheimer.
1. Définitions
1) Démence
2) Maladie d’Alzheimer
2. Historique
3. Dix signes caractéristiques de la maladie d’Alzheimer
4. Différentes formes de la maladie d’Alzheimer
1. Forme sporadique
2. Forme familiale
5. Facteurs pouvant influencer la maladie
A. Facteurs de risque
· L’âge et le sexe
• Facteurs de risque vasculaire
· Facteurs génétiques
• Facteurs environnementaux
B. Facteurs protecteurs
• Vie sociale
• Alimentation
• Activité physique
6. Lésions de la maladie d’Alzheimer
a. Dépôts extracellulaires du peptide B-amyloïde
Voie non-amyloïdogénique
Voie amyloïdogénique
b. Plaques amyloïdes
C. Dégénérescences neurofibrillaires
7. B-sécrétase
Inhibition de BACE1
8. y-sécrétase
9. Traitements
10. Conclusion
Chapitre II: Présentation de la plante Foeniculum vulgare
1. Historique
2. Description botanique
3. Généralités
4. Noms vernaculaires
5. Habitat et répartition géographique
6. Usages
7. Activité antioxydante et antimicrobienne de Foeniculum vulgare
8. Composition chimique du Foeniculum vulgare
9. Conclusion
Chapitre III: Matériel et méthodes.
1. Introduction
2. Matériels
2.1 Microordinateur
2.2 a. Banques de données
2.3 a. Logiciels utilisés
Généralités sur les enzymes
Acides aminés
b. Sécrétases
2.4 Présentation du matériel
3. Méthodologie de travail
3.1 Introduction
3.2 Méthodes de la modélisation moléculaire
Mécanique moléculaire (MM)
Dynamique moléculaire (DM)
Docking moléculaire
3.3 Protocole de travail
Chapitre IV: Résultats et discussion.
1. Préparation de la protéine (l’enzyme)
2. Préparation des ligands
3. Structures chimiques des ligands
4. Etude in silico de l’inhibition de la ẞ-sécrétase
4.1 Docking moléculaire
a. Comparaison entre les complexes formés (4GID-ligands)
b. Interaction Enzyme-Ligand
4.2 Propriétés de Druglikeness
4.3 Tests ADME/T
4.4 Prédiction PASS et prédiction du site de métabolisme P450
4.5 Prédiction de cible
4.6 Modélisation pharmacophore
→ Docking moléculaire des médicaments
❖ Propriétés de de Druglikeness des médicaments
❖ Test ADME/t des médicaments
Conclusion
Références Bibliographiques
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