Effet du delta-tocopherol sur le bcl-2 lors du cancer: Simulation par docking moléculaire
Des informations générales:
Le niveau |
Master |
Titre |
Effet du delta-tocopherol sur le bcl-2 lors du cancer: Simulation par docking moléculaire |
SPECIALITE |
IMMUNOLOGIE |
Page de garde:
Sommaire:
Introduction
Chapitre 1: revue de la littérature
1.Cancer
1.1. Historique et généralités.
1.2. Définition.
1.3. Hallmarks du cancer.
1.4. Immuno-surveillance.
1.5. L’immunoediting.
1.5.1. Les étapes de l’immunoedting.
2. Bcl2.
2.1. Définition et structure du Bcl2.
2.2. Bcl2 et apoptose.
2.3. Les propriétés régulatrices de Bcl-2.
2.4. Voies d’apoptose médiées par la chimiothérapie.
2.5. Dysfonctionnement du bcl-2 et cancer.
3. Delta tocopherol.
3.1. Généralités.
3.2. Propriétés physico-chimiques des tocopherols.
3.3. Source de la vitamine E.
3.4. Rôle biologique de la vitamine E.
3.5. Propriétés immunitaire.
3.6. Delta tocopherol et cancer.
4. Le docking moléculaire.
4.1. Définition.
4.2. Principe.
4.3. Les outils du docking moléculaire.
4.3.1. Ligand.
4.3.2. Récepteur.
4.4. les programmes du docking moléculaire.
4.5. Docking avec ligand rigide, semi flexible, et flexible.
4.5.1. Avec ligand rigide.
4.5.2. Avec ligand semi flexible.
4.5.3. Avec ligand flexible.
4.6. Scoring.
4.6.1. Principe.
4.6.2. Fonction du score.
Chapitre 2. Matériel et méthode.
1. Matériels.
1.1. Microordinateur.
1.2. Programmes.
1.2.1. Argus Lab.
1.2.2. ChemSketch.
1.2.3. Chem3D.
1.2.4. Discovery studio.
1.3. Banques de données.
1.3.1. PDB.
1.3.2. PubChem.
2. Méthodes.
2.1. Source de la protéine cible.
2.2. Source du ligand.
2.3. Préparation de la protéine.
2.4. Préparation du ligand.
2.5. Calcul des grilles de potentiel.
2.6. Docking moléculaire.
Chapitre 3. Résultat et discussion.
1. Règle de lipinski.
2. Réalisation du docking moléculaire.
3. Analyse des interactions.
3.1. Liaisons hydrogènes.
3.2. Liaisons hydrophobes.
Chapitre 4.Conclusion.
Chapitre 5. Références.
Chapitre 1: revue de la littérature
1.Cancer
1.1. Historique et généralités.
1.2. Définition.
1.3. Hallmarks du cancer.
1.4. Immuno-surveillance.
1.5. L’immunoediting.
1.5.1. Les étapes de l’immunoedting.
2. Bcl2.
2.1. Définition et structure du Bcl2.
2.2. Bcl2 et apoptose.
2.3. Les propriétés régulatrices de Bcl-2.
2.4. Voies d’apoptose médiées par la chimiothérapie.
2.5. Dysfonctionnement du bcl-2 et cancer.
3. Delta tocopherol.
3.1. Généralités.
3.2. Propriétés physico-chimiques des tocopherols.
3.3. Source de la vitamine E.
3.4. Rôle biologique de la vitamine E.
3.5. Propriétés immunitaire.
3.6. Delta tocopherol et cancer.
4. Le docking moléculaire.
4.1. Définition.
4.2. Principe.
4.3. Les outils du docking moléculaire.
4.3.1. Ligand.
4.3.2. Récepteur.
4.4. les programmes du docking moléculaire.
4.5. Docking avec ligand rigide, semi flexible, et flexible.
4.5.1. Avec ligand rigide.
4.5.2. Avec ligand semi flexible.
4.5.3. Avec ligand flexible.
4.6. Scoring.
4.6.1. Principe.
4.6.2. Fonction du score.
Chapitre 2. Matériel et méthode.
1. Matériels.
1.1. Microordinateur.
1.2. Programmes.
1.2.1. Argus Lab.
1.2.2. ChemSketch.
1.2.3. Chem3D.
1.2.4. Discovery studio.
1.3. Banques de données.
1.3.1. PDB.
1.3.2. PubChem.
2. Méthodes.
2.1. Source de la protéine cible.
2.2. Source du ligand.
2.3. Préparation de la protéine.
2.4. Préparation du ligand.
2.5. Calcul des grilles de potentiel.
2.6. Docking moléculaire.
Chapitre 3. Résultat et discussion.
1. Règle de lipinski.
2. Réalisation du docking moléculaire.
3. Analyse des interactions.
3.1. Liaisons hydrogènes.
3.2. Liaisons hydrophobes.
Chapitre 4.Conclusion.
Chapitre 5. Références.
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