Conception d’un système de manipulation des ontologies médicales
Des informations générales:
Le niveau |
Master |
Titre |
Conception d’un système de manipulation des ontologies médicales |
SPECIALITE |
Informatique Biomédicale |
Page de garde:
Sommaire:
Introduction Générale
Chapitre I: Les ontologies.
I .1. Introduction
I 2. Historique
I 3. Définition
I .4. Rôle des ontologies.
I .5. Les constituants d’une ontologie
I 5.1. Les classes/ les concepts.
I .5.2. Les relations et les fonctions
I 5.3. Les axiomes.
I.5.4. Les instances
1.6. Le cycle de vie des ontologies
I.6.1. Besoins et évaluation.
I.6.2. Conception etévolution.
I.6.3. Diffusion
I.6.4. Utilisation
I.6.5. Gestion
I.7. Classification des ontologies.
I.7.1. Typologie selon la richesse de la structure interne des ontologies
a) Le vocabulaire contrôlé
b) Le glossaire
c) Le thésaurus
d) La hiérarchie informelle (is-a).
e) La hiérarchie formelle (is-a)
f) La hiérarchie formelle (is-a) avec instances du domaine
g) Le frame
h) Les ontologies avec restrictions de valeur.
i) Les ontologies avec contraintes logiques
I.7.2. Typologie selon l’objet de conceptualisation
a) Les ontologiesde représentation de connaissances.
b) Les ontologies générales ou communes ou génériques c) Les ontologies de niveau supérieur ou de hautniveau d) Les ontologies du domaine.
I.7.3. Typologie selon le niveau de granularité .
a) La granularité fine.
b) La granularité large
I.7.4. Typologie selon le niveau de formalisation utilisé
1.8. Méthodes et Méthodologies de Construction d’ontologie
1.8.1. Le processus de développement d’ontologie .
1.8.2. Les méthodes et méthodologies de développement des ontologies
a) La méthodologie METHONTOLOGY
b) La méthodologie On-To-Knowledge.
c) La méthode Ontology Development 101
d) Les autres méthodes de développement d’ontologies.
I.9. Domaine d’application des ontologies.
I.9.1. Système d’information.
I .9.2. Web sémantique
I .10. Conclusion
Chapitre II: Les langages et les outils d’ontologie
II.1. Introduction
II.2. Les langages de description des ontologies.
II.2.1. Les langages d’ontologies traditionnels.
II.2.2. Les langages d’ontologie web standard ou baséssur XML.
II 3. Les outils de construction d’ontologie
II.3.1. Les outils dépendants du formalisme de représentation.
a. Ontolingua
b.ODE et WebOde.
C. OntoEdit
b. OntoSaurus
C. WebOnto
d. OilEd
II.3.2. Les outils indépendants de formalisme de représentation.
Protégé2000
II 4. Conclusion
Chapitre III: Etat De l’art
III.1. Introduction
III.2. Terminologies.
III.3. Ontologies Vs Terminologies.
III.4. Représentation des ontologies
III .4.1. RDF et RDF(S)
III .4.2. OWL
a. OWL Full
b. OWL DL.
C. OWL Lite
III.5. Construction et édition d’ontologies
III.5.1. Les méthodes et méthodologies pour la construction d’ontologies en partant de zéro
III.5.2. Les méthodes pour la réingénierie d’ontologies.
III 5.3. Les méthodes pour la construction coopérative d’ontologies.
III.6. Enrichissement, maintenance et évolution d’ontologies.
III.7. Exemples d’ontologies et de classifications dans le domaine médical
III .7.1. UMLS.
III .7.2. SNOMED CT.
III .7.3. MeSH
III 7.4. Galen
III.7.5. Digital Anatomist: Foundational Model of Anatomy (FMA)
III.8. Conclusion
Chapitre IV: Application
IV.1. Introduction
IV.2. Outils et langages utilisés
IV.2.1. NetBeans
IV.2.2. Jena.
IV.2.3. JAVA
IV.3. Interfaces
IV.4. Conclusion
Conclusion Générale
Référence Bibliographique
Chapitre I: Les ontologies.
I .1. Introduction
I 2. Historique
I 3. Définition
I .4. Rôle des ontologies.
I .5. Les constituants d’une ontologie
I 5.1. Les classes/ les concepts.
I .5.2. Les relations et les fonctions
I 5.3. Les axiomes.
I.5.4. Les instances
1.6. Le cycle de vie des ontologies
I.6.1. Besoins et évaluation.
I.6.2. Conception etévolution.
I.6.3. Diffusion
I.6.4. Utilisation
I.6.5. Gestion
I.7. Classification des ontologies.
I.7.1. Typologie selon la richesse de la structure interne des ontologies
a) Le vocabulaire contrôlé
b) Le glossaire
c) Le thésaurus
d) La hiérarchie informelle (is-a).
e) La hiérarchie formelle (is-a)
f) La hiérarchie formelle (is-a) avec instances du domaine
g) Le frame
h) Les ontologies avec restrictions de valeur.
i) Les ontologies avec contraintes logiques
I.7.2. Typologie selon l’objet de conceptualisation
a) Les ontologiesde représentation de connaissances.
b) Les ontologies générales ou communes ou génériques c) Les ontologies de niveau supérieur ou de hautniveau d) Les ontologies du domaine.
I.7.3. Typologie selon le niveau de granularité .
a) La granularité fine.
b) La granularité large
I.7.4. Typologie selon le niveau de formalisation utilisé
1.8. Méthodes et Méthodologies de Construction d’ontologie
1.8.1. Le processus de développement d’ontologie .
1.8.2. Les méthodes et méthodologies de développement des ontologies
a) La méthodologie METHONTOLOGY
b) La méthodologie On-To-Knowledge.
c) La méthode Ontology Development 101
d) Les autres méthodes de développement d’ontologies.
I.9. Domaine d’application des ontologies.
I.9.1. Système d’information.
I .9.2. Web sémantique
I .10. Conclusion
Chapitre II: Les langages et les outils d’ontologie
II.1. Introduction
II.2. Les langages de description des ontologies.
II.2.1. Les langages d’ontologies traditionnels.
II.2.2. Les langages d’ontologie web standard ou baséssur XML.
II 3. Les outils de construction d’ontologie
II.3.1. Les outils dépendants du formalisme de représentation.
a. Ontolingua
b.ODE et WebOde.
C. OntoEdit
b. OntoSaurus
C. WebOnto
d. OilEd
II.3.2. Les outils indépendants de formalisme de représentation.
Protégé2000
II 4. Conclusion
Chapitre III: Etat De l’art
III.1. Introduction
III.2. Terminologies.
III.3. Ontologies Vs Terminologies.
III.4. Représentation des ontologies
III .4.1. RDF et RDF(S)
III .4.2. OWL
a. OWL Full
b. OWL DL.
C. OWL Lite
III.5. Construction et édition d’ontologies
III.5.1. Les méthodes et méthodologies pour la construction d’ontologies en partant de zéro
III.5.2. Les méthodes pour la réingénierie d’ontologies.
III 5.3. Les méthodes pour la construction coopérative d’ontologies.
III.6. Enrichissement, maintenance et évolution d’ontologies.
III.7. Exemples d’ontologies et de classifications dans le domaine médical
III .7.1. UMLS.
III .7.2. SNOMED CT.
III .7.3. MeSH
III 7.4. Galen
III.7.5. Digital Anatomist: Foundational Model of Anatomy (FMA)
III.8. Conclusion
Chapitre IV: Application
IV.1. Introduction
IV.2. Outils et langages utilisés
IV.2.1. NetBeans
IV.2.2. Jena.
IV.2.3. JAVA
IV.3. Interfaces
IV.4. Conclusion
Conclusion Générale
Référence Bibliographique
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