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Master académique

Le niveau
Contribution à l’étude de la sensibilité aux antibiotiques des Escherichia coli isolés d’infections urinaires communautaires dans la région de Tiaret

Titre
Infectiologie

SPECIALITE

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Contribution à l'étude de la sensibilité aux antibiotiques des Escherichia coli isolés d'infections urinaires communautaires dans la région de Tiaret

Sommaire:

INTRODUCTION PREMIÈRE PARTIE : ÉTUDE BIBLIOGRAPHIQUE CHAPITRE I: INFECTIONS URINAIRES I.1 Rappel sur le système urinaire I.1.1 Rein I.1.1.1 Structure externe I.1.1.2 Structure interne I.1.2 Uretères I.1.3 Vessie I.1.4 Urètre I.1.5 Urine I.1.5.1 Définition I.1.5.2 Composants de l’urine I.1.5.3 Caractères physico-chimiques de l’urine I.1.5.4 Comparaison entre l’urine normale et l’urine contaminée I.2 Infection urinaire I.2.1 Facteurs de risque I.2.1.1 Facteur liés à la bactérie I.2.1.2 Facteur liés à l’hôte I.3 Types d’infection urinaire I.3.1 Urétrite I.3.2 Cystite I.3.3 Pyélonéphrite I.3.4 Prostatite I.4 Mode de contamination des infections urinaire I.4.1 Voie ascendante I.4.2 Voie descendante I.5 Prélèvement urinaire I.6 Diagnostic I.6.1 Bandelette urinaire I.6.2 Examen macroscopique I.6.3 Examen microscopique I.6.4 Culture bactérienne I.6.5 Antibiogramme CHAPITRE II : ESCHERICHIA COLI II.1 Historique II.2 Habitat II.3 Caractères généraux II.4 Caractères bactériologiques II.4.1 Caractères morphologiques et structurales II.4.2 Caractères biochimiques II.4.3 Caractères génétiques II.4.4 Caractères culturaux II.5 Pouvoir pathogènes d’E. coli II.5.1 E. coli pathogènes intestinaux II.5.2 E. coli pathogène extra intestinaux II.5.3 Escherichia uropathogène (UPEC) II.5.3.1 Facteurs de virulences II.6 Mécanisme d’infection urinaire à E. coli uropathogène UPEC CHAPITRE III: ANTIBIOTIQUES III.1 Définition III.2 Mode d’action III.3 Classification III.4 Résistance aux antibiotiques III.4.1 Définition de la résistance aux antibiotiques III.4.2 Résistance naturelle III.4.3 Résistance acquise III.4.4 Mécanisme de résistance aux antibiotiques III.5 Mécanismes de résistance d’E. coli aux différentes familles d’antibiotique III.5.1 Bêtalactamines III.5.2 Quinolones III.5.3 Nitrofuranes III.5.4 Aminosides III.5.5 Sulfamides et trimethoprime DEUXIÈME PARTIE : ÉTUDE EXPÉRIMENTALE CHAPITRE IV: MATÉRIEL ET MÉTHODES IV.1 Lieu, durée et période de l’étude IV.2 Matériel IV.2.1 Matériel et consommables de laboratoire IV.2.2 Disques d’antibiotiques IV.3 Méthodes IV.3.1 Protocole expérimental IV.3.2 Collecte et traitement des données IV.3.3 Examen des urines IV.3.3.1 Examen macroscopique IV.3.3.2 Examen cytobactériologique des urines IV.3.3.3 Chimie des urines IV.3.3.4 Identification et dénombrement des uropathogènes IV.3.3.5 Evaluation de la sensibilité aux antibiotiques des E. coli isolés CHAPITRE V: RÉSULTATS ET DISCUSSION V.1 Résultats V.1.1 Examens cytobactériologiques des urines (ECBU) V.1.1.1 Répartition globale des ECBU analysée V.1.1.2 Répartition des ECBU positifs selon le genre V.1.2 Analyse bactériologiques V.1.2.1 Répartition globale des germes isolés V.1.2.2 Répartition des germes isolés en fonction du sexe V.1.3 Évaluation de la sensibilité des souches d’E. coli isolées à partir des cas positifs d’ECBU V.1.3.1 Résistance globale aux antibiotiques des E. coli isolés V.1.3.2 Résistance aux antibiotiques des E. coli isolés selon le sexe V.1.3.3 Résistance aux antibiotiques des E. coli isolés selon l’âge et le sexe V.1.3.4 Profile des souches multi-résistantes d’E. coli isolées V.2 Discussion CONCLUSION Perspectives Références Bibliographiques

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