Epidémiologie et potentiel zoonotique des protozoaires parasites, Giardia et Cryptosporidium, chez les animaux d’élevage dans la steppe algérienne : Cas de Laghouat et régions limitrophes
Des informations générales:
Doctorat |
Le niveau |
Epidémiologie et potentiel zoonotique des protozoaires parasites, Giardia et Cryptosporidium, chez les animaux d’élevage dans la steppe algérienne : Cas de Laghouat et régions limitrophes |
Titre |
| Impact des zoonoses parasitaires sur la santé publique via l’eau, les aliments et l’environnement |
SPECIALITE |
Page de garde:
Sommaire:
Introduction
Chapitre I. L’état actuel des connaissances sur Giardia et Cryptosporidium chez les animaux d’élevage et l’homme
I. Historique
I.1. Cryptosporidiose
I.2. Giardiase
II. Biologie et systématique
II.1. Etude de Cryptosporidium
II.1.1. Morphologie et structure
II.1.2. Cycle biologique
II.1.3. Systématique
II.2. Etude de Giardia
II.2.1. Morphologie et structure
II.2.2. Cycle de vie
II.2.3. Systématique
III. Rôle pathogène
III.1. Expression clinique
III.1.1. Cryptosporidiose
III.1.2. Giardiase
III.2. Pouvoir pathogène
VI. Epidemiologie
VI.1. Répartition et prévalence
VI.1.1. Répartition
VI.1.1.1. Répartition en fonction de la situation géographique
VI.1.1.2. Répartition en fonction de l’espèce d’élevage
VI.1.2. Prévalence
VI.2. Sources de contamination et modes de transmission
VI.3. Facteurs prédisposants
VI.3.1. Facteurs intrinsèques
VI.3.2. Facteurs extrinsèques
V. Diagnostic
V.1. Méthodes coproscopiques
V.1.1. Examen microscopique sans coloration
V.1.1.1. Examen direct sans enrichissement
V.1.1.2. Examen direct avec enrichissement
V.1.2. Examen microscopique après coloration
V.1.2.1. Coloration au MIF (Merthiolate Iode Formol)
V.1.2.2. Coloration au Giemsa
V.1.2.3. Coloration à l’hématoxyline ferrique
V.1.2.4. Coloration au trichrome de Gomori-Wheatley
V.1.2.5. Coloration négative de Heine
V.1.2.6. Coloration à l’Auramine-Phénol
V.1.2.7. Coloration de Zeihl-Neelsen modifiée
V.2. Méthodes immunologiques
V.2.1. Le test d’ELISA
V.2.2. Immunofluorescence direct (DFA)
V.2.3. Analyse immunochromatographique (ICT)
V.3. Méthodes moléculaires
V.3.1. Techniques de PCR
V.3.1.1. PCR simple
V.3.1.2. PCR nichée
V.3.1.3. PCR en temps réel (qPCR)
V.3.1.4. PCR multiplexe
V.3.2. Marqueurs (cibles) utilisés en PCR
IV.1. Traitement
IV.2. Prophylaxie
Chapitre II. Méthodologie
I. Echantillonnage
I.1. Régions et sites d’étude
I.2. Animaux et élevages étudiés
I.3. Prélèvement et conservation
II. Analyse de laboratoire
II.1. Analyses par approches classiques
II.1.1. Préparation des frottis et coloration de Ziehl-Neelsen modifiée
II.2.2. Concentration par flottation au sulfate de zinc 33%
II.1.3. Examen microscopique
II.2. Analyse par approches moléculaires
II.2.1. Extraction d’ADN
II.2.2. Analyse PCR
II.2.2.1. Préparation à la PCR
II.2.2.2. Procédure de la PCR
II.2.2.3. Révélation des produits de la PCR
II.2.2.4. Lecture et interprétation des résultats
II.2.3. Séquençage
II.2.3.1. Purification des produits de PCR secondaire
II.2.3.2. Réaction de séquençage
II.2.3.3. Analyse des séquences
III. Analyse statistique
Chapitre III. Résultats et discussion: Etude de Giardia et Cryptosporidium chez les animaux d’élevage dans la steppe centrale d’Algérie
I. Etude par approches classiques
I.1. Résulats des analyses coproscopiques
I.2. Résulats des analyses épidémiologiques
I.2.1. Prévalence
I.2.2. Etude des facteurs de risque
I.2.2.1. Age
I.2.2.2. Le type d’espèce d’élevage
I.2.2.3. Région d’étude
I.2.2.4. Type d’élevage
I.2.3. Statut clinique
I.2.3.1. Fréquence de Giardia spp. en fonction du statut clinique
I.2.3.2. Fréquence de Cryptosporidium en fonction du statut clinique
II. Etude par approches moléculaires
II.1. Caractérisation moléculaire de Giardia intestinalis et Cryptosporidium spp. Chez les animaux d’élevage dans la steppe centrale d’Algérie
II.2. Potentiel zoonotique de G intestinalis associé aux animaux d’élevage dans la steppe centrale d’Algérie
II.3. Potentiel zoonotique de Cryptosporidium spp. associé aux animaux d’élevage dans la steppe centrale d’Algérie
Conclusion et perspectives
References bibligraphiques
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