Evaluation du pouvoir anti-biofilm de quelques huiles essentielles sur des bactéries isolées de sondes urinaires
Des informations générales:
Le niveau |
Master |
Titre |
Evaluation du pouvoir anti-biofilm de quelques huiles essentielles sur des bactéries isolées de sondes urinaires |
SPECIALITE |
Biologie |
Page de garde:
Sommaire:
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Introduction
Partie I: Synthèse Bibliographique
Chapitre I: Les infections associées aux dispositifs médicaux
1. Définition
2. Le dispositif médical
2.1. Sonde urinaire
2.2. Description générale d’une sonde urinaire
2.3. Propriétés et Caractéristiques d’une sonde urinaire
2.3.1. Longueur
2.3.2. Diamètre
2.3.3. Le corps
2.3.4. Nombre de voies
2.3.5. Matériaux
3. Les infections nosocomiales associées à la présence d’une sonde urinaire
4. Etiologie des infections dues à la présence d’une sonde urinaire
5. Les facteurs de risques liés à la présence d’une sonde urinaire
5.1. Les facteurs intrinsèques
5.2. Les facteurs extrinsèques
6. Mécanismes d’acquisition en présence de sonde
6.1. Acquisition lors de la mise en place de la sonde
6.2. Acquisition par voie endoluminale
6.3. Acquisition par voie extraluminale péri-urétrale
6.4. Acquisition par voie lymphatique ou hématogène
Chapitre II: Généralité sur le Biofilm
1. Historique et découverte des Biofilms
2. Qu’est-ce qu’un biofilm et pourquoi s’y intéresser ?
3. Structure des Biofilms (Composition et organisation)
4. Le cycle de vie d’un biofilm et sa régulation
4.1. Les étapes de la formation d’un biofilm
4.1.1. L’adhésion des cellules bactériennes à la surface
4.1.1.1.Mise en place d’un film conditionnant
4.1.1.2. L’adhésion réversible
4.1.1.3.L’adhésion irréversible
4.1.2. Formation des microcolonies
4.1.3. Maturation de biofilm
4.1.4. Dispersion des bactéries
4.2. Les facteurs favorisant la formation d’un biofilm
4.2.1. Caractéristiques de la surface
4.2.2. Caractéristiques de milieu
4.2.3. Propriétés des cellules
4.3. Régulation d’un biofilm : Quorum sensing
4.3.1. Définition et mécanisme
4.3.2. Le Quorum sensing chez les bactéries à Gram négatives
4.3.3. Le Quorum sensing chez les bactéries à Gram positives
5. La tolérance aux antibiotiques
6. Les principales bactéries formatrices de biofilm sur les sondes urinaires
6.1. Klebseilla pneumoniae
6.2. Escherichia coli
6.3. Enterobacter cloacae
6.4. Pseudomonas aeruginosa
6.5. Staphylococcus aureus
Chapitre III: Traitement des biofilm par les plantes médicinales
1. Cinnamomum zeylanicum
1.1. Nomenclature
1.2. Description botanique
1.3. Usages thérapeutique
2. Lavandula officinalis
2.1. Nomenclature
2.2. Description botanique
2.3. Usages thérapeutique
3. Zingiber officinale Roscoe
3.1. Nomenclature
3.2. Usages thérapeutique
Partie II: Partie expérimentale
1. Matérielet méthodes
1.1. Lieu d’étude
1.2. Prélèvement
1.3. Ensemencement et isolement
1.4. Identification
1.5. Conservation des souches
1.6. Evaluation de la formation du biofilm in vitro
1.6.1. Méthode de Plaque de Culture de tissus (TCP)
1.6.1.1. Lecture
1.6.2. Détection de la production de slime sur milieu Rouge Congo Agar (RCA)
1.6.3. Méthode en Tube
1.6.3.1. Lecture
1.7. Activité anti biofilm d’Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus
1.8. L’effet de quelques huiles essentielles sur un biofilm préformé
2. Résultats et discussion
2.1. Prélèvement
2.2. Identification des souches
2.2.1. Aspect macroscopique
2.2.2. Caractères biochimiques par le système miniaturisé API
2.2.2.1. Klebseilla pneumoniae
2.2.2.2. Escherichia coli
2.2.2.3. Enterobacter cloacae
2.2.2.4. Staphylococcus aureus
2.2.3. Résultat de test de coagulase chez S. aureus
2.2.4. Résultat de test d’oxydase chez P.aeruginosa
2.3. Résultat d’Evaluation de la formation de biofilm chez les souches isolées
2.3.1. Méthode de Plaque de Culture de tissus (TCP)
2.3.2. La méthode de Rouge Congo (RCA)
2.3.3. La méthode en Tube (TM)
2.4.Résultats de l’effet de quelques huiles essentielles sur un biofilm préformé
2.4.1. L’huile de Lavandula officinalis
2.4.2. L’huile de Cinnamomum zeylanicum
2.4.3. L’huile de Zingiber officinale Roscoe
Conclusion
Références bibliographiques
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Introduction
Partie I: Synthèse Bibliographique
Chapitre I: Les infections associées aux dispositifs médicaux
1. Définition
2. Le dispositif médical
2.1. Sonde urinaire
2.2. Description générale d’une sonde urinaire
2.3. Propriétés et Caractéristiques d’une sonde urinaire
2.3.1. Longueur
2.3.2. Diamètre
2.3.3. Le corps
2.3.4. Nombre de voies
2.3.5. Matériaux
3. Les infections nosocomiales associées à la présence d’une sonde urinaire
4. Etiologie des infections dues à la présence d’une sonde urinaire
5. Les facteurs de risques liés à la présence d’une sonde urinaire
5.1. Les facteurs intrinsèques
5.2. Les facteurs extrinsèques
6. Mécanismes d’acquisition en présence de sonde
6.1. Acquisition lors de la mise en place de la sonde
6.2. Acquisition par voie endoluminale
6.3. Acquisition par voie extraluminale péri-urétrale
6.4. Acquisition par voie lymphatique ou hématogène
Chapitre II: Généralité sur le Biofilm
1. Historique et découverte des Biofilms
2. Qu’est-ce qu’un biofilm et pourquoi s’y intéresser ?
3. Structure des Biofilms (Composition et organisation)
4. Le cycle de vie d’un biofilm et sa régulation
4.1. Les étapes de la formation d’un biofilm
4.1.1. L’adhésion des cellules bactériennes à la surface
4.1.1.1.Mise en place d’un film conditionnant
4.1.1.2. L’adhésion réversible
4.1.1.3.L’adhésion irréversible
4.1.2. Formation des microcolonies
4.1.3. Maturation de biofilm
4.1.4. Dispersion des bactéries
4.2. Les facteurs favorisant la formation d’un biofilm
4.2.1. Caractéristiques de la surface
4.2.2. Caractéristiques de milieu
4.2.3. Propriétés des cellules
4.3. Régulation d’un biofilm : Quorum sensing
4.3.1. Définition et mécanisme
4.3.2. Le Quorum sensing chez les bactéries à Gram négatives
4.3.3. Le Quorum sensing chez les bactéries à Gram positives
5. La tolérance aux antibiotiques
6. Les principales bactéries formatrices de biofilm sur les sondes urinaires
6.1. Klebseilla pneumoniae
6.2. Escherichia coli
6.3. Enterobacter cloacae
6.4. Pseudomonas aeruginosa
6.5. Staphylococcus aureus
Chapitre III: Traitement des biofilm par les plantes médicinales
1. Cinnamomum zeylanicum
1.1. Nomenclature
1.2. Description botanique
1.3. Usages thérapeutique
2. Lavandula officinalis
2.1. Nomenclature
2.2. Description botanique
2.3. Usages thérapeutique
3. Zingiber officinale Roscoe
3.1. Nomenclature
3.2. Usages thérapeutique
Partie II: Partie expérimentale
1. Matérielet méthodes
1.1. Lieu d’étude
1.2. Prélèvement
1.3. Ensemencement et isolement
1.4. Identification
1.5. Conservation des souches
1.6. Evaluation de la formation du biofilm in vitro
1.6.1. Méthode de Plaque de Culture de tissus (TCP)
1.6.1.1. Lecture
1.6.2. Détection de la production de slime sur milieu Rouge Congo Agar (RCA)
1.6.3. Méthode en Tube
1.6.3.1. Lecture
1.7. Activité anti biofilm d’Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus
1.8. L’effet de quelques huiles essentielles sur un biofilm préformé
2. Résultats et discussion
2.1. Prélèvement
2.2. Identification des souches
2.2.1. Aspect macroscopique
2.2.2. Caractères biochimiques par le système miniaturisé API
2.2.2.1. Klebseilla pneumoniae
2.2.2.2. Escherichia coli
2.2.2.3. Enterobacter cloacae
2.2.2.4. Staphylococcus aureus
2.2.3. Résultat de test de coagulase chez S. aureus
2.2.4. Résultat de test d’oxydase chez P.aeruginosa
2.3. Résultat d’Evaluation de la formation de biofilm chez les souches isolées
2.3.1. Méthode de Plaque de Culture de tissus (TCP)
2.3.2. La méthode de Rouge Congo (RCA)
2.3.3. La méthode en Tube (TM)
2.4.Résultats de l’effet de quelques huiles essentielles sur un biofilm préformé
2.4.1. L’huile de Lavandula officinalis
2.4.2. L’huile de Cinnamomum zeylanicum
2.4.3. L’huile de Zingiber officinale Roscoe
Conclusion
Références bibliographiques
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