Evaluation de la formation de biofilms des souches d’Acinetobacter baumannii isolées de dispositifs médicaux au CHU de Tlemcen
Des informations générales:
Le niveau |
Doctorat |
Titre |
Evaluation de la formation de biofilms des souches d’Acinetobacter baumannii isolées de dispositifs médicaux au CHU de Tlemcen |
SPECIALITE |
Biologie Option Microbiologie |
Page de garde:
Sommaire:
Introduction
Première partie : synthèse bibliographique
Chapitre 1 : Les caractéristiques du genre Acinetobacter spp.
1. Taxonomie.
2. Caractères bactériologiques
2.2.Caractères morphologiques
2.3.Caractères culturaux
3. Caractères biochimiques
4. Habitat
5. Epidémiologie
6. A. baumannii et infections associées aux soins
6.1.Pneumopathies acquises sous ventilation
6.2.Les bactériémies associées aux cathéters
6.3.Les infections associées au sondage urinaire
6.4.Méningites
6.5.Infection de la peau
Chapitre 2: Les facteurs de virulence chez A. baumannii.
1. Le biofilm
1.1.Définition et étapes de formation du biofilm
1.2. Propriété du biofilm
1.2.1. Résistance aux antibiotiques
1.2.2. La résistance à l’immunité
1.2.3. Rapidité d’acquisition d’éléments génétiques
1.3. Les facteurs influençant la formation de biofilm d’A. baumannii.
1.3.1. Les propriétés bactériennes
1.3.1.1. L’hydrophobicité
1.3.1.2. Le pili
1.3.1.3. La protéine Bap (biofilm-associated protein
1.3.1.4. Le poly-ẞ-1,6-N-acetylglucosamine (PNAG)
1.3.2. Les caractéristiques de la surface du dispositif médical.
1.3.2.1. La nature du matériau
1.3.2.2. La charge de surface et le caractère hydrophobe des matériaux
1.3.2.4. La rugosité de la surface
1.3.2.5. Présence de films protéiques sur la surface
1.3.3. Les caractéristiques du milieu aqueux
1.4. Autres facteurs de virulence
1.4.1. La résistance aux antibiotiques
1.4.2. Les lipopolysaccharide (LPS)
1.4.3. La protéine de membrane externe A (OmpA).
1.4.4. Le quorum sensing
1.4.5. L’activité enzymatique
1.4.6. La régulation de fer
Deuxième partie : Matériel et méthodes
1. Prélèvements
2. Ensemencement.
3. Identification
4. Sensibilité aux Antibiotiques
5. Etude de la formation de biofilm d’Acinetobacter baumannii.
5.1. La méthode tube (TM)
5.2. La méthode de Plaque de culture de tissus (TCP)
6. Etude de l’hydrophobicité de la paroi bactérienne d’A. baumannii
6.1. La méthode MATH (Microbial Adhesion to Hydrocarbure)
6.2. Le test d’agglutination ou le Salt Aggregation Test (SAT).
7. Etude de la formation de biofilm d’A. baumanii sous conditions de culture
8. Cinétique de la formation de biofilm d’A. baumannii
9. Etude de la formation de biofilm d’A. baumannii sur différents biomatériaux.
9.1. Préparation des supports
9.2. Détermination de l’hydrophobicité de la surface des substrats solides
9.3. Adhésion d’A. baumannii sur le PVC, le silicone et le latex
Troisième partie : Résultats et discussion
1. Prélèvements
2. Identification de l’espèce A. baumannii
3. Antibiogramme
4. Evaluation de la formation de biofilm chez A. baumannii
5. Etude de l’hydrophobicité de la paroi bactérienne d’A. baumannii
6. Influence des conditions de culture sur la formation de biofilm d’A. baumannii
6.1. Influence de la température
6.2. Influence du Glucose et du NaCl
7. Cinétique de la formation de biofilm chez A. baumannii.
8. Influence de la nature du dispositif médical sur la formation de biofilm par
A. baumannii.
Conclusion générale.
Références bibliographiques
Première partie : synthèse bibliographique
Chapitre 1 : Les caractéristiques du genre Acinetobacter spp.
1. Taxonomie.
2. Caractères bactériologiques
2.2.Caractères morphologiques
2.3.Caractères culturaux
3. Caractères biochimiques
4. Habitat
5. Epidémiologie
6. A. baumannii et infections associées aux soins
6.1.Pneumopathies acquises sous ventilation
6.2.Les bactériémies associées aux cathéters
6.3.Les infections associées au sondage urinaire
6.4.Méningites
6.5.Infection de la peau
Chapitre 2: Les facteurs de virulence chez A. baumannii.
1. Le biofilm
1.1.Définition et étapes de formation du biofilm
1.2. Propriété du biofilm
1.2.1. Résistance aux antibiotiques
1.2.2. La résistance à l’immunité
1.2.3. Rapidité d’acquisition d’éléments génétiques
1.3. Les facteurs influençant la formation de biofilm d’A. baumannii.
1.3.1. Les propriétés bactériennes
1.3.1.1. L’hydrophobicité
1.3.1.2. Le pili
1.3.1.3. La protéine Bap (biofilm-associated protein
1.3.1.4. Le poly-ẞ-1,6-N-acetylglucosamine (PNAG)
1.3.2. Les caractéristiques de la surface du dispositif médical.
1.3.2.1. La nature du matériau
1.3.2.2. La charge de surface et le caractère hydrophobe des matériaux
1.3.2.4. La rugosité de la surface
1.3.2.5. Présence de films protéiques sur la surface
1.3.3. Les caractéristiques du milieu aqueux
1.4. Autres facteurs de virulence
1.4.1. La résistance aux antibiotiques
1.4.2. Les lipopolysaccharide (LPS)
1.4.3. La protéine de membrane externe A (OmpA).
1.4.4. Le quorum sensing
1.4.5. L’activité enzymatique
1.4.6. La régulation de fer
Deuxième partie : Matériel et méthodes
1. Prélèvements
2. Ensemencement.
3. Identification
4. Sensibilité aux Antibiotiques
5. Etude de la formation de biofilm d’Acinetobacter baumannii.
5.1. La méthode tube (TM)
5.2. La méthode de Plaque de culture de tissus (TCP)
6. Etude de l’hydrophobicité de la paroi bactérienne d’A. baumannii
6.1. La méthode MATH (Microbial Adhesion to Hydrocarbure)
6.2. Le test d’agglutination ou le Salt Aggregation Test (SAT).
7. Etude de la formation de biofilm d’A. baumanii sous conditions de culture
8. Cinétique de la formation de biofilm d’A. baumannii
9. Etude de la formation de biofilm d’A. baumannii sur différents biomatériaux.
9.1. Préparation des supports
9.2. Détermination de l’hydrophobicité de la surface des substrats solides
9.3. Adhésion d’A. baumannii sur le PVC, le silicone et le latex
Troisième partie : Résultats et discussion
1. Prélèvements
2. Identification de l’espèce A. baumannii
3. Antibiogramme
4. Evaluation de la formation de biofilm chez A. baumannii
5. Etude de l’hydrophobicité de la paroi bactérienne d’A. baumannii
6. Influence des conditions de culture sur la formation de biofilm d’A. baumannii
6.1. Influence de la température
6.2. Influence du Glucose et du NaCl
7. Cinétique de la formation de biofilm chez A. baumannii.
8. Influence de la nature du dispositif médical sur la formation de biofilm par
A. baumannii.
Conclusion générale.
Références bibliographiques
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