EFFET DES DESINFECTANTS SUR LES BACTERIES A GRAM NEGATIF D’ORIGINE HOSPITALIERE
Des informations générales:
Le niveau |
Master |
Titre |
EFFET DES DESINFECTANTS SUR LES BACTERIES A GRAM NEGATIF D’ORIGINE HOSPITALIERE |
SPECIALITE |
Biologie Moléculaire et Cellulaire |
Page de garde:
Sommaire:
Introduction .1
1. Epidémiologie des infections nosocomiales3
1.1. Définitions des infections nosocomiales .31.2. Réservoir et transmission .3
1.3. Infections nosocomiale dans les services de maternité .3
1.3.1. Les types infections nosocomiales dans les services de maternité 4
1.3.2. Infection du site opératoire dans les services de maternité4
1.3.3. Les bactéries dominantes dans l’environnement du bloc opératoire5
2. Les bacilles à Gram-négatif5
2.1. La paroi des bactéries à Gram négatif .5
2.2. Les bacilles à gram-négatif d’origine hospitalière .6
2.2.1. Les entérobactéries 7
2.2.2. Les bacilles à Gram négatif non fermentant (BGNnF):.9
3. La prévention contre les bactéries pathogènes présentées dans les milieux hospitaliers: .11
3.1. Les antibiotiques: 11
3.1.1. Définition: .11
3.1.2. Classification et mécanisme d’action: .11
3.2. Les désinfectants .13
3.2.1. Définition.13
3.2.2. Notion des agents anti-microbiens (biocide/antibiotique).14
3.2.3. Mode d’action et classification des désinfectants.14
3.2.4 Facteurs Influençant L’efficacité de désinfection 17
4. La résistance et l’adaptation des BGN aux agents antibactériennes.18
4.1. La résistance aux antibiotiques18
4.1.1. La résistance naturelle .18
4.1.2. La résistance acquise .19
4.2. Résistance Aux Désinfectants 20
4.2.1. La résistance naturelle:21
4.2.2. La résistance acquise 22
4.3. Résistance liée à l’état adhérant et/ ou en biofilm.23
4.4. La résistance croisée aux antibiotiques et biocides: 24
1. Matériel .26
1.1. Matériel biologique .26
1.1.1. Souches étudiées261.2. Milieux de culture .26
1.2.1. Milieux de culture liquides26
1.2.2. Milieux de culture solides .26
1.3. Tests biochimiques 27
1.4. Solutions et tampons .27
1.5. Les enzymes 27
1.6. Grand matériel27
1.7. Les produits consommables 27
1.8. Antibiotiques .28
1.9. Les désinfectants testés28
2. Méthodes .29
2.1. Méthodes phénotypiques.29
2.1.1 Lieu d’étude29
2.1.2 Prélèvements: .29
2.1.3 Isolement et purification30
2.1.4. Identification .30
2.1.5 Conservation des souches.33
2.1.6. Etude de la résistance aux antibiotiques33
2.1.7. Etude de la résistance aux désinfectants35
2.2 Méthode génotypique37
2.2.1 Extraction d’ADN bactérien.37
2.2.2. La recherche du gène de résistance aux biocides par la PCR37
2.2.3 ERIC-PCR:.39
2.2.4 L’électrophorèse sur gel d’agarose.41
2.2.5 Séquençage.42
1. Résultats 47
1.1.Prélèvements .47
1.2.Souches étudiées47
1.3. Résistance des BGN aux antibiotiques.50
1.4. Les résultats des CMI par la méthode de microtitration.52
1.6. La recherche des gènes qacE qacΔE1 55
1.7. Typage moléculaire 57
Discussions59
Conclusion.66Références
bibliographiques
1. Epidémiologie des infections nosocomiales3
1.1. Définitions des infections nosocomiales .31.2. Réservoir et transmission .3
1.3. Infections nosocomiale dans les services de maternité .3
1.3.1. Les types infections nosocomiales dans les services de maternité 4
1.3.2. Infection du site opératoire dans les services de maternité4
1.3.3. Les bactéries dominantes dans l’environnement du bloc opératoire5
2. Les bacilles à Gram-négatif5
2.1. La paroi des bactéries à Gram négatif .5
2.2. Les bacilles à gram-négatif d’origine hospitalière .6
2.2.1. Les entérobactéries 7
2.2.2. Les bacilles à Gram négatif non fermentant (BGNnF):.9
3. La prévention contre les bactéries pathogènes présentées dans les milieux hospitaliers: .11
3.1. Les antibiotiques: 11
3.1.1. Définition: .11
3.1.2. Classification et mécanisme d’action: .11
3.2. Les désinfectants .13
3.2.1. Définition.13
3.2.2. Notion des agents anti-microbiens (biocide/antibiotique).14
3.2.3. Mode d’action et classification des désinfectants.14
3.2.4 Facteurs Influençant L’efficacité de désinfection 17
4. La résistance et l’adaptation des BGN aux agents antibactériennes.18
4.1. La résistance aux antibiotiques18
4.1.1. La résistance naturelle .18
4.1.2. La résistance acquise .19
4.2. Résistance Aux Désinfectants 20
4.2.1. La résistance naturelle:21
4.2.2. La résistance acquise 22
4.3. Résistance liée à l’état adhérant et/ ou en biofilm.23
4.4. La résistance croisée aux antibiotiques et biocides: 24
1. Matériel .26
1.1. Matériel biologique .26
1.1.1. Souches étudiées261.2. Milieux de culture .26
1.2.1. Milieux de culture liquides26
1.2.2. Milieux de culture solides .26
1.3. Tests biochimiques 27
1.4. Solutions et tampons .27
1.5. Les enzymes 27
1.6. Grand matériel27
1.7. Les produits consommables 27
1.8. Antibiotiques .28
1.9. Les désinfectants testés28
2. Méthodes .29
2.1. Méthodes phénotypiques.29
2.1.1 Lieu d’étude29
2.1.2 Prélèvements: .29
2.1.3 Isolement et purification30
2.1.4. Identification .30
2.1.5 Conservation des souches.33
2.1.6. Etude de la résistance aux antibiotiques33
2.1.7. Etude de la résistance aux désinfectants35
2.2 Méthode génotypique37
2.2.1 Extraction d’ADN bactérien.37
2.2.2. La recherche du gène de résistance aux biocides par la PCR37
2.2.3 ERIC-PCR:.39
2.2.4 L’électrophorèse sur gel d’agarose.41
2.2.5 Séquençage.42
1. Résultats 47
1.1.Prélèvements .47
1.2.Souches étudiées47
1.3. Résistance des BGN aux antibiotiques.50
1.4. Les résultats des CMI par la méthode de microtitration.52
1.6. La recherche des gènes qacE qacΔE1 55
1.7. Typage moléculaire 57
Discussions59
Conclusion.66Références
bibliographiques
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